Основната структура на газовия хроматограф има две части, единица за анализ и единица за показване. Първото включва главно източник на газ и контролно измервателно устройство, устройство за вземане на проби, термостат и хроматографска колона. Последното включва главно верификатори и автоматични записващи устройства. Хроматографската колона (включително неподвижната фаза) и калибраторът са основните компоненти на газовия хроматограф.
(1) Система за газ носител Газовата верига в газовия хроматограф е затворена тръбопроводна система, в която газът носител работи непрекъснато. Цялата система с газ-носител изисква чист газ-носител, добра херметичност, стабилен дебит и точно измерване на дебита.
(2) Система за вземане на проби Вземането на проби е да се добави газ или течна проба към горния край на хроматографската колона бързо и количествено.
(3) Система за разделяне Ядрото на системата за разделяне е хроматографската колона, която се използва за разделяне на многокомпонентни проби на отделни компоненти. Има два вида хроматографски колони: пълни колони и капилярни колони.
(4) Функцията на детектора на системата за откриване е да преобразува компонентите на пробата, разделени от хроматографската колона, в електрически сигнали според техните характеристики и съдържание и след усилване записващото устройство ги записва в хроматограма.
(5) Система за записване на сигнали или компютърна обработка на данни През последните години газовите хроматографи използват главно процесори за хроматографски данни. Хроматографският процесор за данни може да отпечата и запише хроматограмата и може да отпечата обработените резултати, като време на задържане, масова част на измерените компоненти и т.н. на същата хартия за запис.
(6) Система за контрол на температурата Използва се за контрол и измерване на температурата на хроматографската колона, детектора и камерата за газификация и е важна част от газовия хроматограф. Газовите хроматографи се разделят на две категории: едната е хроматография газ-твърдо вещество, а другата е хроматография с разпределение газ-течност. Стационарните фази, разделени от тези два вида хроматографи, са различни, но структурата на инструментите е обща.